Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dtx3lQ3UIR3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dtx3lQ3UIR3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dtx3lQ3UIR3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dtx3lQ3UIR3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms