Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eif3j1Q3UGC7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Eif3j1Q3UGC7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eif3j1Q3UGC7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3j1Q3UGC7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms