Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp36Q3UFY0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rrp36Q3UFY0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms