Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip13Q3UA06 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip13Q3UA06 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms