Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LbrQ3U9G9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LbrQ3U9G9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms