Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops9Q3U898 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms