Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3U6N9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3U6N9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3U6N9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U6N9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U6N9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U6N9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3U6N9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3U6N9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3U6N9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3U6N9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3U6N9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3U6N9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3U6N9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3U6N9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Q3U6N9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3U6N9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3U6N9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3U6N9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3U6N9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms