Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4G0

Uncharacterized protein C15orf41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U4G0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U4G0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U4G0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U4G0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U4G0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U4G0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q3U4G0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U4G0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U4G0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U4G0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q3U4G0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U4G0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U4G0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U4G0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U4G0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U4G0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U4G0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U4G0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U4G0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U4G0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U4G0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U4G0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U4G0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U4G0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U4G0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U4G0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U4G0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U4G0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U4G0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U4G0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U4G0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q3U4G0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q3U4G0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U4G0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U4G0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U4G0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U4G0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U4G0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U4G0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U4G0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U4G0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U4G0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U4G0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U4G0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U4G0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U4G0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U4G0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U4G0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U4G0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U4G0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U4G0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U4G0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U4G0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U4G0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U4G0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms