Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Palb2Q3U0P1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Palb2Q3U0P1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Palb2Q3U0P1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Palb2Q3U0P1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms