Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl4Q3TZA2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl4Q3TZA2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl4Q3TZA2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl4Q3TZA2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl4Q3TZA2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl4Q3TZA2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl4Q3TZA2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms