Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem88bQ3TYP4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88bQ3TYP4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem88bQ3TYP4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem88bQ3TYP4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms