Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfyve27Q3TXX3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms