Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trmt1Q3TX08 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt1Q3TX08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt1Q3TX08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms