Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccdc136Q3TVA9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ccdc136Q3TVA9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc136Q3TVA9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ccdc136Q3TVA9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms