Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21440Q3TTD8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms