Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pnpla6Q3TRM4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pnpla6Q3TRM4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pnpla6Q3TRM4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pnpla6Q3TRM4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms