Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c3Q3TMP1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms