Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Smarca4Q3TKT4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Smarca4Q3TKT4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Smarca4Q3TKT4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Smarca4Q3TKT4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Smarca4Q3TKT4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Smarca4Q3TKT4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms