Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4cQ3TKR3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4cQ3TKR3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms