Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp39Q3TIX9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp39Q3TIX9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp39Q3TIX9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms