Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc69Q3TCJ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms