Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl9Q32KG4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl9Q32KG4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms