Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox4fQ2MDF8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox4fQ2MDF8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox4fQ2MDF8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox4fQ2MDF8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox4fQ2MDF8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox4fQ2MDF8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox4fQ2MDF8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox4fQ2MDF8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox4fQ2MDF8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms