Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Shroom4Q1W617 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Shroom4Q1W617 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
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Shroom4Q1W617 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Shroom4Q1W617 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Shroom4Q1W617 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
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