Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim71Q1PSW8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim71Q1PSW8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms