Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300lgQ1ERP8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300lgQ1ERP8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300lgQ1ERP8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd300lgQ1ERP8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms