Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tdrd9Q14BI7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tdrd9Q14BI7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Tdrd9Q14BI7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Tdrd9Q14BI7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tdrd9Q14BI7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms