Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Perm1Q149B8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Perm1Q149B8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Perm1Q149B8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Perm1Q149B8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Perm1Q149B8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Perm1Q149B8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Perm1Q149B8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Perm1Q149B8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Perm1Q149B8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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