Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc39dQ0VF76 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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