Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r181Q0P547 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r181Q0P547 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r181Q0P547 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms