Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kndc1Q0KK55 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kndc1Q0KK55 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kndc1Q0KK55 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kndc1Q0KK55 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kndc1Q0KK55 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms