Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700061G19RikQ08EE8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms