Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q08AU9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q08AU9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q08AU9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q08AU9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q08AU9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q08AU9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q08AU9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q08AU9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q08AU9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q08AU9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q08AU9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q08AU9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q08AU9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q08AU9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q08AU9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q08AU9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q08AU9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q08AU9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q08AU9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q08AU9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q08AU9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q08AU9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q08AU9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q08AU9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q08AU9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q08AU9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q08AU9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q08AU9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q08AU9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q08AU9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q08AU9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q08AU9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q08AU9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q08AU9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q08AU9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q08AU9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q08AU9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q08AU9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q08AU9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q08AU9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q08AU9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q08AU9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q08AU9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q08AU9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q08AU9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q08AU9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q08AU9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q08AU9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q08AU9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q08AU9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q08AU9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q08AU9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q08AU9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q08AU9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms