Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SctQ08535 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SctQ08535 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SctQ08535 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SctQ08535 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SctQ08535 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SctQ08535 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SctQ08535 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SctQ08535 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SctQ08535 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SctQ08535 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SctQ08535 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SctQ08535 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SctQ08535 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SctQ08535 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SctQ08535 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SctQ08535 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SctQ08535 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SctQ08535 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SctQ08535 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SctQ08535 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SctQ08535 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SctQ08535 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SctQ08535 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SctQ08535 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SctQ08535 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SctQ08535 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SctQ08535 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SctQ08535 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SctQ08535 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SctQ08535 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SctQ08535 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SctQ08535 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SctQ08535 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SctQ08535 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SctQ08535 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SctQ08535 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SctQ08535 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SctQ08535 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SctQ08535 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SctQ08535 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SctQ08535 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SctQ08535 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SctQ08535 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SctQ08535 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SctQ08535 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SctQ08535 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SctQ08535 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SctQ08535 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SctQ08535 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SctQ08535 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SctQ08535 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SctQ08535 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SctQ08535 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SctQ08535 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SctQ08535 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SctQ08535 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SctQ08535 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SctQ08535 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SctQ08535 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SctQ08535 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SctQ08535 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SctQ08535 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SctQ08535 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SctQ08535 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SctQ08535 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SctQ08535 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SctQ08535 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SctQ08535 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SctQ08535 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SctQ08535 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SctQ08535 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SctQ08535 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SctQ08535 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SctQ08535 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SctQ08535 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SctQ08535 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SctQ08535 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SctQ08535 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SctQ08535 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SctQ08535 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SctQ08535 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SctQ08535 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SctQ08535 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SctQ08535 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SctQ08535 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2804.1 ms