Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F13bQ07968 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F13bQ07968 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F13bQ07968 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F13bQ07968 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F13bQ07968 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F13bQ07968 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F13bQ07968 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
F13bQ07968 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F13bQ07968 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.5 ms