Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrstQ06666 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrstQ06666 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrstQ06666 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrstQ06666 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrstQ06666 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrstQ06666 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrstQ06666 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrstQ06666 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrstQ06666 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrstQ06666 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrstQ06666 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms