Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox10Q04888 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox10Q04888 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms