Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nf1Q04690 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nf1Q04690 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms