Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnd1Q03719 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kcnd1Q03719 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnd1Q03719 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnd1Q03719 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms