Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col6a2Q02788 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col6a2Q02788 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col6a2Q02788 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col6a2Q02788 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms