Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax5Q02650 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax5Q02650 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms