Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnnb1Q02248 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnnb1Q02248 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnnb1Q02248 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms