Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcqQ02111 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcqQ02111 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcqQ02111 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms