Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxd1Q01822 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd1Q01822 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms