Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Top2aQ01320 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Top2aQ01320 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Top2aQ01320 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Top2aQ01320 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms