Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gja5Q01231 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gja5Q01231 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gja5Q01231 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gja5Q01231 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms