Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb2Q00977 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjb2Q00977 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjb2Q00977 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms