Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp4Q00724 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms