Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
F8a1Q00558 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8a1Q00558 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms