Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GabpaQ00422 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GabpaQ00422 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GabpaQ00422 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms